Начиная с конца 50-х годов ХХ века СКТБ «Биофизприбор» выполняло многочисленные заказы Министерства обороны для военно-морского флота. Были разработаны тренажёры-имитаторы «Шторм», «Волна», «Парус», «Прилив», «Яхта», «Изделие», «Лотос» и др. Тренажёры имитировали работу пультов и систем управления кораблей ВМФ – главной энергетической установки, систем управления и защиты реактора, системы управления движением корабля, навигационного и гидроакустического комплексов и ряда других общекорабельных систем.
Функционирование этих технических систем нередко сочеталось с контролем состояния, психофизиологической оценкой и оценкой профессиональной деятельности специалистов различного профиля - операторов систем управления, водолазов - глубоководников, боевых пловцов.

Комплекс «Прибой» регистрировал биопотенциалы головного мозга и обеспечивал их автоматический анализ.
Комплексы «Парус» и «Волна» имитировали психофизиологические условия деятельности человека-оператора по управлению кораблём в длительных экспериментах. Одновременно исследовались характеристики надёжности и эффективности оператора, анализировалась динамика управления.
С помощью комплекса «Прилив» по показателям умственной работоспособности изучались память и степень утомления вахтенных операторов.
Значительный объём работ был выполнен предприятием для обеспечения исследований и контроля состояния водолазов, как в экспериментальных, так и в реальных условиях погружения.

Ещё в конце 60-х годов по заказу ВМФ был разработан оригинальный для того времени прибор «Тахотонометр» - для контроля состояния подводников путём измерения температуры тела, артериального давления, времени ответной реакции, частоты пульса с распечаткой результатов на специальной карточке. Заложенные в прибор многие принципиальные методические и технические решения были затем использованы при разработке систем профилактического медицинского контроля.
 

.

Комплекс медицинских обследований
"Тахотонометр"
 

Схожие задачи по исследованию водолазов выполнял более совершенный комплекс «Трезубец», регистрировавший электрокардиограмму в 12 отведениях, биопотенциалы головного мозга по 4 каналам, температуру тела, частоту дыхания.

Проведение НИР «Привычка» в 70-80 годы позволило исследователям выбрать оптимальные физиологические показатели и их параметры, отработать методики для изучения состояния водолазов при погружении на большие глубины. Результатом работы явилось создание комплекса «Приворот». Одна часть комплекса была предназначена для оперативного медицинского контроля испытателя в камере высокого давления (до 50 кГс/см²) с искусственной газовой средой и обеспечивала обследование сердечно - сосудистой, дыхательной, нервной систем, регистрацию температуры тела и актограммы сна. Другая часть позволяла изучать психофизиологические характеристики человека при проведении эксперимента.

Комплекс «Дельфин» был предназначен для обеспечения на борту аварийно - спасательного средства контроля состояния пострадавших при морских катастрофах. При этом проводился оперативный медицинский контроль 12 человек по частоте сердечных сокращений (ЧСС) и температуре с поочередной индикацией данных. Также обеспечивался углублённый контроль 8 человек с одновременной индикацией для одного человека всех параметров (ЧСС с выводом сигнала ЭКГ на стандартный электрокардиограф; величины и знака изменения температуры).

В СКТБ был разработан и поставлен заказчику ряд комплексов для проверки психофизиологического состояния испытателей и экипажей подводных лодок («Эмоция», «Рефлекс», «Синапс»). В этих устройствах основу составляли классические и общепринятые методики: зрительно-моторная реакция в различных вариантах (ЗМР простая, сложная, с выбором), критическая частота слияния световых мельканий (КЧСМ), реакция на движущийся объект (РДО), динамометрия (ДМ), теппинг-тест. В разные комплексы дополнительно включались методики: «закон силы раздражителя» на свет и звук (ЗС), тремор (ТР), различные варианты слежения за объектом и др.

Психофизиологический комплекс
"Синапс"
 

Обязательным элементом в работе этих устройств была статистическая обработка получаемых результатов согласно заданным алгоритмам с вычислением 10-20 статистических параметров по каждому физиологическому показателю. На основании этих данных оценивалась психофизиологическое состояние личного состава и его готовность к выполнению ответственных профессиональных задач.

Для оценки двигательной активности членов экипажей в зоне отдыха подводных лодок был создан комплекс «Трек», обеспечивавший контроль частоты пульса по ЭКГ при выполнении физической нагрузки на тренажёрах – велоэргометре и беговой дорожке. На специальных пультах имитировалось движение «велосипедиста» по кругу (при двух тренажёрах имитировалось соревнование двоих) с измерением и индикацией пути, времени прохождения кругов, пути в целом и т.д. Схожие показатели фиксировались и на беговой дорожке с одного человека. На объекты ВМФ и судостроительные предприятия было поставлено 22 комплекта аппаратуры «Трек» различных модификаций.

В конце 80-х годов для проведения исследований в объекте на базе НИИ ГМТ был разработан комплекс МАК в составе: аппаратуры оперативного контроля «Альфа-10», комплекса углублённых исследований «Гамма-3», психофизиологического комплекса «Синапс» и оригинального тренажёра «Сирена» (для изучения под водой физического и физиологического состояния боевых пловцов).
Работы по морской тематике велись с участием в качестве медицинских соисполнителей сотрудников НИИ гигиены морского транспорта (ныне НИИ ПММ), Военно-медицинской академии.